Die Geschäftsstelle ist als neutrale Fachinstanz Anlaufstelle für alle Akteurinnen und Akteure im Gesundheitsbereich und ermöglicht Beteiligung und Austausch. Sie verantwortet dazu die organisatorische und inhaltliche Gremien- und Projektarbeit und stellt den Kontakt zu landesweit tätigen Gremien des Gesundheitswesens her. Daneben sorgt die Geschäftsstelle für eine effizientere Nutzung von Fachwissen und Daten sowie eine stärkere Sichtbarkeit und Wirksamkeit der Präventionsarbeit durch die Ermittlung regionaler Bedarfe und der Sicherung von Qualität von Umsetzungsprozessen. Angesiedelt ist die Geschäftsstelle am Gesundheitsamt der Stadt Ingolstadt.